Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933406M09RikG3XA12 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933406M09RikG3XA12 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms