Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Arfgef1G3X9K3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms