Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms