Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5160F8VPN3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5160F8VPN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms