Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8220F6YKI2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8220F6YKI2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms