Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms