Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Erich3F6QRE9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich3F6QRE9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms