Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN3

Gm1979, Predicted gene 1979, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1979E9QAN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1979E9QAN3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1979E9QAN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1979E9QAN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1979E9QAN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms