Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cald1E9QA15 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cald1E9QA15 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms