Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc7bE9Q9Y3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms