Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Cdh18E9Q9Q6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Cdh18E9Q9Q6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms