Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f1E9Q9P8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f1E9Q9P8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms