Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc141E9Q8Q6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc141E9Q8Q6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc141E9Q8Q6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms