Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga10E9Q6R1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms