Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Simc1E9Q6E9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms