Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms