Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BC005561E9Q5E2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms