Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DspE9Q557 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms