Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5031410I06RikE9Q4E0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5031410I06RikE9Q4E0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5031410I06RikE9Q4E0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5031410I06RikE9Q4E0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms