Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3893E9Q1I1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms