Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ryr1E9PZQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ryr1E9PZQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms