Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scaf11E9PZM7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scaf11E9PZM7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms