Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms