Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5415E9PXF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms