Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn4E9PX29 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms