Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30dE9PWL0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30dE9PWL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms