Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930407I10RikD3Z5T8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930407I10RikD3Z5T8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms