Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc6D3YZP9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms