Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lce6aD3YV94 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms