Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cttnbp2B9EJA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms