Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pdzd8B9EJ80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms