Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms