Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cped1B2RX70 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cped1B2RX70 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms