Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf518aB2RRF6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms