Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brpf3B2KF05 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms