Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Mbd5B1AYB6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mbd5B1AYB6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd5B1AYB6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms