Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm13178B1AVU7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm13178B1AVU7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms