Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trabd2bB1ATG9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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