Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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