Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll11A4Q9F4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll11A4Q9F4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms