Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn3aA2ASI5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scn3aA2ASI5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms