Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtcflA2APF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtcflA2APF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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