Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FocadA2AKG8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FocadA2AKG8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms