Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc4a11A2AJN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms