Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Lcn6A2AJB9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn6A2AJB9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn6A2AJB9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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