Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramel3A2AHA7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms