Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ambra1A2AH22 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ambra1A2AH22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ambra1A2AH22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms