Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms