Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm2A2A7B5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms