Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav12-2A0N8N6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Trav12-2A0N8N6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trav12-2A0N8N6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav12-2A0N8N6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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